关于基于NGS数据对HLA分型精度限制的影响因素的讨论
一、reads内SNP的密度
HLA区域许多reads因为携带的SNP过多，而无法mapping到参考基因组上。这里的“unmapping”通常指该read在基因组许多位置具有相似的比对打分，很难将该read分配到其中任意一个位置。
而且Mapping Quality的计算也依赖于该原理：
科研菜狗
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一、reads内SNP的密度
HLA区域许多reads因为携带的SNP过多，而无法mapping到参考基因组上。这里的“unmapping”通常指该read在基因组许多位置具有相似的比对打分，很难将该read分配到其中任意一个位置。
而且Mapping Quality的计算也依赖于该原理：