分子群体遗传学
群体遗传学中，演化驱动力比如突变、迁移、选择和随机遗传漂变都会对DNA分子序列上的变异图谱产生可见的影响。分子群体遗传学的一个重点是推断每种演化驱动力对序列变异图谱的贡献大小，涉及数学建模、统计参数推断和试验观测。
一、中性理论和分子演化
中性理论
**开创人：**Motoo Kimura
**理论要点：**分子层面，大多数多态性变异是选择中性的，它们的群体频率动态主要由随即遗传漂变过程决定。
**用途：**当对分子数据进行中性检验时，若变异拒绝中性假设，那么可以联系到对应的因素，比如突变异质性，抽样过程误分类，潜在群体结构，迁移和自然选择。
1. 中性理论的理论背景
大多数突变是选择中性的，主要由随即遗传漂变过程决定，也会有非常少的突变是有害的，会在选择过程中被清除掉，还会有极少的突变是适应环境的，会在选择作用中快速固定下来。
中性突变模型有无限等位基因模型、无限位点模型和有限位点模型。所有模型中，代际间的随机遗传漂变过程都可以理解为从N个个体提供的无限大小的配子池中，随机抽取2N个等位基因组成下一代N个合子的过程。
中性理论的具体内容：
参考书籍：Principles of Population Genetics 4th edition